Село как церковный приход известно с 17-го века. Благовещенский храм входил в состав Белгородской и Курской Епархий. Храм был освящён в честь Благовещения Пресвятой Богородицы. На протяжении XVIII-XIX веков сменилось несколько деревянных зданий храма, которые строились на средства прихожан и местных землевладельцев-дворян.
Издревле в селе славилась священническая династия Булгаковых, составлявшая весь клир храма. Среди священников Благовещенской церкви были: Михаил Осипович Булгаков (служил в 1760-е — 1790-е гг.), Михаил Булгаков (1874-1883 гг.), Пётр Булгаков (1893-1898 гг.), Григорий Васильевич Иваницкий (1898-1902 гг.), Сергей Иванович Логинов (с 1902 г.).
Деревянные храмы, которых было несколько, строились на средства прихожан и местных землевладельцев-дворян. Последний храм был построен в 1890 году прихожанами — каменный с колокольней. Приход был достаточно бедным: земли — 33 десятины, жалования не было, кружечных доходов — 250 рублей в год, на которые содержался клир: священник и псаломщик; библиотека в 33 тома. Значительную финансовую помощь храму оказывал церковный староста — купец Петр Николаевич Приземин.
Рядом с храмом располагалось приходское кладбище с несколькими склепами-усыпальницами местных дворянских и купеческих родов. Достопримечательностью села была могила Матрены Рыжковой-Павловой, знаменитой «Неизвестной» с картины И.Н. Крамского.
Храм был закрыт на основании решения Облисполкома от 19 апреля 1936 года. Службы в храме не велись до 1990-х годов. За это время была утрачена колокольня, которую сейчас прихожане пытаются восстановить. Сейчас Богослужения возобновлены, прихожане стараются восстановить утраченную святыню.
Священники прихода:
1. Михаил Осипович Булгаков родился в с.Миленино в семье клирика храма в 1743 году. Служил в 1760-1790 годах.
2. Михаил Булгаков — в службе с 1874 года, умер — 24.1.1883 г.
3. Петр Булгаков — в службе с 18.6.1893, умер 24.3.1898 года.
4. Григорий Васильевич Иваницкий родился в 1871 года в семье диакона. Окончил КДС 30.5.1896, псаломщик Покровского храма г.Фатежа с 25.6.1896 года, учитель пения в Покровской ЦПШ в 1896-1898, грамматики в соборной женской школе, рукоположен во священники с.Миленино — 14.7.1898 года. Учитель Миленинского народного двухкомплектного училища в 1898-1902 гг. Переведен в с.Гниловод Фатежского уезда 21.2.1902 года. Награжден: набедренником — 1907, скуфьей — 1902.
Сергей Иванович Логинов родился в с.Троицкое на Прутах Фатежского уезда. Окончил КЛС по 2 разряду — 27.7.1894. Псаломщик Фатежского Богословского собора — 14.11.1894, рукоположен во священники с.Миленино — 14.10.1902 года, преподавал в трех местных земских школах, за что получил благодарность от училищного совета в 1913 году.
В 1999 году был назначен священник иерей Анатолий Крыгин и в 2002 году протоиерей Николай Кобелев.
Храм расположен на открытом пространстве в центре села. За ним находится сельское кладбище. Внешнее оформление здания исполнено в кирпичном стиле. В основании храм имеет форму креста.
Адрес: 307107, Курская область, Фатежский район, с. Миленино
Настоятель: иерей Николай Кобелев